複数デスクトップ環境でのEmEditorの使用について

複数のデスクトップ環境を切り替える機能を持つソフトウェア(注)を立ち上げていると、異なるデスクトップ上でEmEditorを使用することができないようです(後から実行したEmEditorが起動しない)。
同時起動するようにはできないでしょうか？

(注)仮想デスクトップのように大画面を分割して仮想的にデスクトップを割り当てるのではなく、実際に複数枚のデスクトップ環境を持つものです。スイッチャと呼ばれているようです。当方ではGeoSwitcher
(http://www.vector.co.jp/soft/winnt/util/se212705.html)
を使用しています。