nayaです。
2重化の仕様変更で、副次的に（?）以前要望した（http://groups.yahoo.co.jp/group/emeditorj/message/04325）
複数行も二重化されるようになってすごくうれしいです。
一文字でも選択されている状態でCtrl+Shift+Yすると、
二重化された両方の行のテキストが選択状態になるのですが、選択せずキャレットを2行目の最後において欲しいです。
（あるいは、選択されていないときも2重化完了後は対象文字列を選択する、みたいに、要は選択/不選択を統一して欲しいという意味です）
あと、どうでもいいですが、キーボードマップにある下記の行の文言が少し変更になりませんかね？
「編集 行の2重化 Ctrl+Shift+Y カーソルのある論理行全体を2重化します。」