開発お疲れ様です。
早速、v14.2.2をダウンロードしました。
ctags.cnfの件は、仰る通りに上手く動作するようになりました。どうやら、ドライブ直下でなくてもEmEditorのルートディレクトリ（EmEditor.exeと同じディレクトリ）にファイルを入れる事でも可能でした。ありがとうございます。
ほんの些細なことですが、エディタに直接関係のない事柄でも、ヒントとなるようにマニュアルに反映していただけると有り難いです。
プロジェクトプラグインのキーボードショートカットについてですが、「Ctrl+Shift+任意キー」は機能するようになりましたが、「Ctrl+Shift+任意キー」で登録しておいたショートカットキーが「Alt+Ctrl+Shift+任意キー」でも動作します。「Alt」キーと「Ctrl、Shift」の組み合わせを登録しても認識しません。どうやら「Alt」キーの判定がおかしいようです。