[snow]

お疲れさまです。

「行番号を表示」「1重引用符」「ここで設定する関連付けを有効にする」等々、チェックボックスで設定する項目は、見たところすべてちらつくようです。
デスクトップテーマは使っておりません。デザインは「Windowsクラシックスタイル」「Windowsスタンダード」になっています。

どうも、チェックボックス本体および文字列のすべてを、再描画しているように見えるのですが…。
gdi++を入れると描画が重くなるので、より顕著にちらつきが見えます（gdi++なしでもちらつきます）。