自己レスで失礼します。
下記の対応でどうやら解決したようです。
解決方法がマズければ正しい方法を教えて頂きたいです。
1.アプリケーションの追加と削除で、ヘルプを削除
2.C:\ProgramData\Emurasoft\EmEditor内のHelpフォルダを削除
3.ローカルヘルプ、http://files.emeditor.com/help/emed_help_ja_19.6.0.msiをダウンロードし、インストール
4.[ヘルプ(H)]-[更新のチェック(C)…]を実行
→最新バージョンである旨表示される。
どうやら私の環境特有の問題だったようです。
Windowsログオンに使用しているユーザをつい先日変更しておりました。(まったく別のユーザ名)
AユーザでインストールしたローカルヘルプをBユーザで更新しようとすると、Helpフォルダの所有者が違うために失敗するようです。
(どちらもユーザもAdministratorsグループに所属していますが)