江村様
アドバイスありがとうございます。
先の報告後、v15.9.0に戻しておりましたので早速確認してみましたが、こちらの環境では同様の現象が再現されました。
１）
v15.9.0 でワークスペース保存→v16.0.0 beta 2にアップデートし、ワークスペース復元で現象再現しました。
２）
一度、ワークスペースを完全に削除してからということでしたので、
v16.0.0 beta 2にアップデート後、自動ワークスペースの設定を「なし」にしてEmEditorが終了、起動することを確認し、
EmEditorで何もファイルを開いてない状態にし、
園後、設定をトピックトップのものにし、ファイルをEmEditorの複数ウィンドウで開き、EmEditor終了、再度EmEditorを起動した場合に、
現象再現しました。
この現象が再現すると、EmEditorを起動すると現象が再現し、EmEditorが使用出来なくなってしまいますので、
再度ご確認を頂けませんでしょうか。
よろしくお願いいたします。