XoopsのCSS選択機能でユーザー毎にCSS(フォントサイズ変更)選択できるようにしてはいかがでしょう。
個人的には、ちょっと大きすぎて見にくいです。1024*788のモニタだとはみ出してしまうのです。
>ＩＥでのフォント指定は明朝体で、サイズは最小を指定しています。
>デスクトップでのフォントサイズは、明朝の9ポイントです。
これだと、EmEditorのサイトに限らず、CSSのフォント設定でsmallerとか90%や.09em等の設定があると、どんどん小さくなる気がします。絶対サイズ指定(10px)などのWEBページは正しく表示できても、相対サイズ指定(smaller)等のページはどれもフォントが小さくなりすぎてませんか？