portable版を試用しています。
v6でも同じ現象ですが、ここに書き込ませてください。
v6では気付かず、v7をインストールして単にEmEditorを起動し直したところ、表示内容が変化したことで気付いた小さな事です。
これは恐らくMy Documentsの場所を「%System Drive%/Documents and Settings/%UserName%/My Documents」
以外の場所に移動している場合だけの挙動かと思われますが、v7をインストールした直後、EmEditorを起動すると
「マイドキュメント」がエクスプローラプラグインのデフォルトのパスになりますが、2回目以降の起動時には「マイコンピュータ」
下の移動先パスがツリーが展開された状態で表示されます。
「マイドキュメント」にカーソルキーでもってフォーカスを移し直し、EmEditorを起動し直しても同じでした。