qtv 様
いつも EmEditor Professional をお使いいただき、誠にありがとうございます。
こちらではまだ再現しませんが、何か、プラグインと関連している可能性はあるかと思います。
最新版のプロジェクト プラグインでは、現在アクティブなファイルだけのシンボル リストを表示できるようになったので、FunctionList プラグインの代わりにお使いになれるかと思います。
まもなく公開する v11.9.90 RC (正式版候補) では、アウトライン プラグインの一部のオプションを修正していますので、それでも試していただけると幸いです。こちらでも、継続して調べてみます。
どうぞよろしくお願い申し上げます。