[takuya]

私が、良くやる方法は、保存時設定を書き換えて、一括して改行コードを変更する方法ですね。

設定のプロパティー->ファイル->保存時->保存時の改行コード

でCR+LFにしておき、開いてCTRL+Sするだけで一気に変換できます。

警告が鬱陶しいのであれば、改行コードの不一致警告をOFFにしてしまうとか。

ファイルサイズがある程度小さいのであれば改行コードをばっさり置換しちゃうのも手かもしれない。r を消して n をrnにするとか。