redakt55 様
いつもお世話になっております。江村です。
おそらく、問題は、何らかの条件で発生しているのだと思われるため、プラグインとマクロをすべて無効にして試していただけると幸いです。
それでも問題が再現する場合、現在の設定をエクスポートして（レジストリの HKEY_CURRENT_USER\Software\EmSoft をエクスポートでも可能）から、 [すべての設定をリセット] を実行してからお試しください。
これにより問題が再現しなくなった場合には、再現するファイルのサンプル、および上記のレジストリ ファイルを .zip に圧縮して、メールで送っていただけると幸いです。
メニューの違いについてですが、おそらく、メイン メニューがカスタマイズされているからだと思います。[メニューの変更] ダイアログでリセットしてみてください。
大変ご迷惑をお掛けして申し訳ありません。
よろしくお願い申し上げます。