[qtv]

やっていて気付きましたが、WindowsではInitialDirectoryプロパティでフォルダは指定できるがEmEditorでは指定していない、という意味なのですね。
(Windowsの仕様のため指定できない、という意味かと思っていました。)
設定できるのであれば要望として挙げておきます。