江村さん
ご回答ありがとうございます。
1について、v15.0.2のレジストリを先にエクスポート済みでしたので、それを使いましたがアイコン情報は引き継がれませんでした。（復元は行わず）
そのため、関連付けの設定でアイコンを登録しなおしましたがやはり反映はされません。
その後、該当ファイル右クリックしプロパティから、プログラムにEmEditorを改めて指定したところ、反映されました。
ただ、ひとまず正常に戻したあと、v15.1.2を上書きインストールしたところ、また初期化されてしまいました。（txt と 独自に登録した拡張子のアイコン）
2については時間が取れないので、週末でにも確認します。
