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15.1.2をインストールしてみました。
エクスプローラで 複数フォルダを選択して 右クリックメニュー「EmEditorでファイルから検索」が出てきませんでした。

ツール>カスタマイズ＞ショートカット の 設定を見てOn/OFFやリセットをしてみましたが 変化なしでした。

以前から 複数フォルダを選択した右クリックメニューには「EmEditor」という名称のメニューがあり、今回も出てきていますがこの機能は「ファイルを開く」もののようなので関係ないですよね。