開発お疲れ様です。
似たような不具合を確認したので、こちらに書かせていただきます。
使用しているのは、XPSP3 上の v9.11。
開いたテキストに対して正規表現で置換えを行い、置換ウィンドウを表示したまま、EmEditorの本体にフォーカスを移します。
その状態で CTRL+H で置換ウィンドウを呼び出す（見かけは置換ウィンドウにフォーカスが戻る）と、「検索する文字列」にセットしてある正規表現式の「￥」が増えてしまうようです。
([w、。ー「」])n(w)
が
([w、。ー「」])n(w)
になるなど。
「検索」は問題なしです。
お手数ですが、ご確認のほどをお願い申し上げます。
