私も同じような状況になり、応答なしのあいだ EmEditorでほかの作業が出来ず、困っております。
EmEditorのバージョン : ‘14.5.4’
編集中ファイルの設定 : ‘Text’
100MB,25万行のテキストファイルから 正規表現のOR (A|B|C ～)を使って500単語の文字列にブックマークを付ける操作をすると
検索に長時間かかり、キャンセルボタンを押しても10秒どころではなく数分の間フリーズします。
検索１単語あたり、１０文字以上で、正規表現全体としては６０００文字程度の条件です。
一度のキャンセルボタンでは検索が止まっていないように見えます（キャンセルボタンを押してしばらく待っていると、再び検索をしているように見えるため、またキャンセルを押すということが必要なように見えます）
動きを見ていると、無駄な検索の試行をしているように見えます。
何らかの対策（一度キャンセルボタンを押せば、数１０秒以内に反応し確実にキャンセルが終わるように）をお願いしたいです。