[ファイルから検索]画面で[高度]ボタンをクリックし、[高度]画面で、「次のファイルまたはフォルダを無視する」がチェックされていて、さらに、そのすぐ下の「無視するファイルまたはフォルダ」で「_*」などと指定されていないでしょうか？
当方の環境では、上記のように設定されていなければ、sasaki1985さんの書かれているような[ファイルから検索]の条件で該当ファイルが検索結果にヒットされることを確認できました。
環境
OS ：Win7 Ultimate (32bit)
EmEditor：Pro 10.0.1
最近アップデートをさぼっているので、EmEditor の最新版では試していません。
以上