HTML,CSS ファイルは,文字コードを明示する仕組みがあるので,拡張子が .htm, .html, .css のファイルについては,(その記述があった場合)その文字コードで開けばいいと思うんですが,如何でしょうか。
もちろん,その記述と実際の文字コードが一致していないこともありうるわけですが,その場合は警告を出してやればいいと思います。
現在「開くときのエンコード」を「UTF-8」にしているのですが,この状態で Shift_JIS の HTML ファイル,CSS ファイルを開くときにダイアログが二回も余計に出てきて面倒です。