開発お疲れ様です。
EmEditor Professional v13 ベータ 6 (v12.9.5)を
Win7 Home SP1 64bit で使っていて不具合と思われる挙動があります。
１２
あい
上記の文字列で、「１」と「２」、「あ」と「い」の間を幅０で上から箱型選択します。
その状態で、「ａｂ」と入力すると
１ａｂ２
あａｂい
となり、ここで、「選択開始位置と終了位置を入れ替え」ると、
カーソル位置が「１」と「ａ」の間になりますが、
「ｃｄ」と入力すると
１ａｂｃｄ２
あａｂｃｄい
となります。
カーソルが左上にあったにもかかわらず。
正直、これがバグなのか、そういうものなのか判断付きかねるのですが、
左上にカーソルがあるときは、そこに追加したほうが直観的だと思います。