いつも迅速なご対応ありがとうございます．
比較オプションの品質について大変よくわかりました．
かなり難しいことをされているのですね．
私の使い方であればさほど大きなブロック単位の違いは必要ありませんので，デフォルトの3程度で問題ないことがわかりました．
異なる行の抽出リストでなくても，全体的に異なる行がどのくらいあるか確認する方法はないでしょうか．
小さなファイルであればそうでもないのですが，大きなファイルで全体的な違いを把握するときに，diffの異なる行だけ表示する機能は大変役立ってましたので．
違うソフトで申し訳ありませんが，Rekisaというフリーソフトがあります．
http://frozenlib.net/rekisa/
このような全体的な確認ができることをイメージしています．
一度ご検討していただければ幸いです．
よろしくお願いします．