[naya]

v3.39でプラグインが使えたか、記憶が定かでないですが。
わたしはcss,html,php,jsファイルだけをeuc-jpに、その他は
Shift_JISで使いたいため、次のプラグインを利用させて
いただいてます。ご参考までに。
http://homepage2.nifty.com/okajima/encodingconf/encodingconf.htm