takahiro 様
いつも EmEditor Professional をお使いいただき、誠にありがとうございます。
EmEditor と Excel でクリップボードの競合が起きている可能性があります。
EmEditor でクリップボード履歴の機能が必要ない場合には、
レジストリエディタで、 HKEY_CURRENT_USERSoftwareemsoftEmEditor v3Common に MaxClipboardHistory という REG_DWORD 値を 0 で設定すれば、クリップボード履歴を使用しなくなります。
お試しいただけますでしょうか?
どうぞよろしくお願い申し上げます。