[inakyu]

私も同様の問題が同様の時期から出ています。
「Windows10 Home 64bit の Anniversary Update を適用」
64bit版EmEditor ver：16.1.3

具体的には、以下の画像のような状況です。
https://drive.google.com/file/d/0B-TvQU14VqQjQ0cxMEl0eGdxZ0E/view?usp=sharing