なるほど，そういうことですか。
文字幅の平均値などというものに意味があるのかどうか疑問ですし，平均値が x の幅になるというのが普遍的とはとても思えませんが，それはそれとして。
ルーラーの目盛りが何を表すかは置いておいて，インデントガイドはルーラーと切り離して考える，というわけにいかないのでしょうか。
ルーラーは，和文全角・欧文半角のような特殊なフォントを除けば〈目安〉にしかなりませんが，インデントについては，スペース 2 個のインデントの位置はスペースの幅 2 個分右に移動した位置であって，何ら曖昧性がありません。
よって，インデントガイドは当該フォントのスペースの幅を基準に引いてくれればどんなフォントを持ってきても誰もが happy だと思うのですが。
> ソース コードの表示に使用される場合には、固定幅のフォントを使われることをおすすめします。
Source Han Code JP は固定幅フォントです。