Autumn 様
いつも EmEditor をお使いいただき、誠にありがとうございます。
その中途半端に表示されている行というのは、文書をスクロールダウンしないと表示できないような場所になるのでしょうか? そうだとすると、[カスタマイズ] ダイアログの [CSV] タブで、[表示されている行のみで区切り位置を調節] チェック ボックスのチェックを外しておけば、最初の行から 1,000 行までの間で区切り位置を調節します。それより下の部分についても調節したい場合には、[区切り位置を調節 (文書全体)] コマンドを実行してください。これをマクロで TSV への変更の直後に記憶させておけば、両方一度に実行できます。
よろしくお願い申し上げます。