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・CSVモードで列を選択(トリプルクリック）し、複数列を選択、DELETEキーを押すと その場ではすぐに削除が行われません。
マウスでほかの場所をクリックするとそのタイミングで削除が行われます。

ご確認ください。

↑すみません、発言を取り下げます。
1万行、10列ほどの CSVを操作していたのですが、単に 動作が遅くて DELETEの結果がついてきていないだけでした。