選択範囲のみの置換で、 量指定子がある時とない時で、正規表現の置換動作が異なってます。
これは解釈の問題かもしれません。.+? だったら、最小の文字列と一致するので問題ないのですが、.+ だと最大長の文字列と一致しなければならないので、選択範囲を超えて一致する方が正しいともいえますね。
http://jp.emeditor.com/modules/xoopsfaq/index.php?cat_id=5&com_id=3&com_rootid=3&#comment3
は、こちらでは v6.00.4、v7.00 alpha ともに、再現しないですね。何か条件があるのでしょうか?