bbfcさんは書きました：
EmEditor を起動する際に、 EmEditor のアイコンで右クリックして、「管理者権限で実行」を選択して EmEditor を実行すれば、問題はなくなります。
EmEditorを管理者権限で実行中に、低権限のExploer.exeからD&Dでファイルを開くことができません。これを回避するにはExploerを管理者権限で実行するしかないと考えています。
しかし、Exploerを管理者権限で実行することはその上で行われる操作に管理者権限が与えられるのでUACを動作させていることと矛盾が生じます。
確かにその通りですが、このあたりは Windows Vista のデザインと絡み合って難しい問題ではあります。機会があるたびに検討してみます。