一時マクロを開いた時の既定の現在のフォルダは、[マクロ] メニューの [カスタマイズ] の [オプション] タブで設定できます。
その設定を確認したところ、フォルダパスではなく、マクロファイルのフルパスになってました。それが原因だったようです。ファイル名の部分を消したところ、ステータスの表示/外部ツールの動作とも、期待する正常どうさになりました。
バージョンアップの話は、確かにRCだけだったかもしれません。
上書きではなく、一旦アンインストールしてから、新しいバージョンでインスールということでしょうか。 アンインスールせずそのまま上書きって出来ないのでしょうか。
それから、MSIだと右クリックメニューに、RunAsがでないのですが、
RunAsでMSIを実行すると何かまずいのでしょうか？
普段はパワーユーザーですので、インストール時に管理者権限
に切り替えるのが面倒になったかなとちょっと思います。