開発お疲れ様です。
EmEditor Professional v13 ベータ 1 (v12.9.0) の 64bitインストーラ版を
Windows7 Home Edition SP1 64bit で使うと問題があるようです。
(32bitポータブル版ではこの問題は出ないようです)
「ジャンプ」「並べ替えのオプション」「半角/全角変換」検索ダイアログの「カスタマイズ」「カスタマイズ」「ツールバーの変更」「メニューの変更」「エンコードの定義」「マーカーのカスタマイズ」「プラグインの設定」「バージョン情報」を選ぶと、
「コンピュータに VirtualizerSDK64.dll がないため、プログラムを開始できません。この問題を解決するには、プログラムを再インストールしてみてください。」
というメッセージボックスが出ます。
ＯＫをクリックすると、
「Cannot load ○○EmEditorEMEDDLGS.DLL.」
というメッセージボックスが表示されます。
必要なDLLが同梱されてないように思います。