betaを使い始めたころからなのですが、
EUCで記述している２MBほどのテキストファイルを開くと、改行だけ表示されたファイルとしてひらくことがあります。
「現在のエンコード」を「シフトJIS」にして読み直すと内容は表示されますが、当然化けます。
この状態で改めて、日本語（EUC）にして読み直すとやはり改行だけになり、その他の文字が一切表示されなくなります。
beta23でも同様の現象が発生しています。
関係ないとは思いますが、すべてのプラグインをオフ、マクロのイベントも無効にしてテストしましたが改善されませんでした
■動作環境
Windows Vista Business
RAM 2037MB
カスタマイズの
一時ファイルを使ってメモリ使用量を削減する：有効
一時ファイルを使う最低ファイルサイズ：２MB
変更されていない行を元のファイルから読む：有効
ちなみに、ここで一時ファイルの設定を無効にすると症状は改善されました。