[snow]

ありがとうございます。
ただ、ワークスペースに登録しているファイルは3つ、すべてローカルのファイルなのです。
また、すぐに閉じてしまったので確認はできませんが、これら3つのファイルはすべて表示された上で、上記ダイアログが上がっていたと思います。
現状、とくに登録していたファイルが消えたようなことはありません。