[ツール]→[カスタマイズ]→[ウィンドウ]→[最後の文書を閉じるときウィンドウ
を閉じない]の設定で、最後の文書を閉じたときの動作は変更できますよ。
オプションによらず元の文書と差し替えるには、
document.selection.SelectAll(); //元の文書をすべて選択
document.selection.Delete(1); //削除
document.selection.InsertFromFile(filename) //スペルチェック済みのファイルを挿入
なんていかがでしょうか。
