nineさんは書きました：
(1)ファイルを保存するときにパスワードを設定してblowfish等で暗号化する機能
EmEditorから少し離れてしまう返信で恐縮ですが、(1)に関しては、任意のテキスト情報をBLOWFISHで暗号化できればよいのであれば、「TOMBO」というツールがあります。
下記の場所から入手できると思います。
http://tombo.sourceforge.jp/
私も任意のテキスト情報をそれなりに実績のある暗号化方式で暗号化したかった時に探してこのツールを見つけて以来、暗号化が必要なファイルの作成・保存にはこれを使わせて頂いています。
ソースも公開されていて安心感があり、またPDAでも使えるので気に入っています。
注意点としては、バージョン1.x系列では取り扱えるファイルのサイズに制限があるため(約30KB)、それより大きなファイルを扱う場合は、ファイルを適当なサイズに分割するか、または今のところベータ版扱いとされている2.0beta1以降を使う必要があります。
http://sourceforge.jp/forum/forum.php?thread_id=5686&forum_id=1014
http://tombo.sourceforge.jp/history.html#200609062300
以上、ご参考まで。