3p3b 様
いつも EmEditor Professional をお使いいただき、誠にありがとうございます。
設定のプロパティの [ファイル] タブの [外部で変更された時] には何を選択されているでしょうか? ここで、[読み直すかどうか選択する] がチェックされている場合、外部でファイルを変更して、EmEditor をアクティブにしたとき、「外部でファイルが変更されています。読み直しますか?」というメッセージが表示されることがありますが、このとき、カーソルが砂時計の状態でフリーズしたように見えていても、キーボード (スペース キーなど) は効くことがあります。もう一度試していただけると幸いです。
他にも何かご質問がございましたらご遠慮なくご発言ください。
今後もどうぞよろしくお願い申し上げます。