moritaK 様
いつも EmEditor Professional をお使いいただき、誠にありがとうございます。
こちらで Virtual PC の Windows XP SP3 で、v8.06 から v11 beta へのアップグレードの再現テストを行ってみましたが、やはり v11 beta を最初に起動時に、最初に更新チェッカーの設定のダイアログが表示されました。ここで、更新をチェックしないを選択すれば、更新をチェックすることはありません。なぜ、お客様の環境だと最初に更新チェッカーの設定ダイアログが表示されないのかわかりませんが、こちらでも再度、調べて見ます。
どうぞよろしくお願い申し上げます。