[alphonce]

お世話になってます。

>EmEditor で、CTRL + V とやって貼り付けできないでしょうか?

EmEditorで通常のCtrl+VはOKです。（問題なし）

>プロパティのキーボードで、リセットをクリックして設定を既定に戻してみてください。

やってみましたが、NGでした。

その後ですが、外部アプリケーション（QTClip）の開発者さんからベータ版（改善版?）を提供していただいて試したところ、発生していた問題は改善したようです。

お騒がせしてすみませんでした。