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スレ主です。
確認が遅くなりましたが、先ほどｖｅｒ．6.00.2をインストールしたところ、問題はあっさり解決しました。
もしかしたら、この問題は6.00.1においては周知のものだったのでしょうか。
とにかくお騒がせして申し訳ありませんでした。
これからもEmEditorを利用させていただきますが、また何かありましたらよろしくお願いいたします。