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説明が足りないところがありました、失礼しました。

プロパティを確認後、次のステップに移る前に毎回カスタマイズウィンドウを閉じています。
確認するたびにカスタマイズを開いています。
この前提でご確認いただけますでしょうか。

カスタマイズウィンドウを開きっぱなしにして、チェックがOn/Offすると言う話ではありません。その場合にOn/Off変化しないのは確認しています。

EmEditorは最新版の 11.0.4を使用しています。

よろしくお願いいたします。