[takuya]

クリックで開くのはプラグインのソースを弄らないと無理だと思います。残念です。。。

“EmEditorに関連付けられていない形式のファイルはデフォルトを維持する設定が欲しい”
このようにエクスプローラープラグインの要望に挙げてみてはいかがでしょうか。