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いつも EmEditor Professional をお使いいただき、誠にありがとうございます。
巨大ファイルを開くと、「折り返さない」で開く仕様になっています。この巨大ファイルと判断する基準は、[カスタマイズ] ダイアログの [高度] タブの [一時ファイルを開く最小サイズ] で指定します。この値を調節していただければ、より大きなファイルでも折り返したままで開くことができますが。動作速度が遅くなったり不安定になることがありますので注意しならが試してみてください。なお、不具合が修正されていることがあるため、常に最新の EmEditor をお使いになることを推奨します。
他にもご質問がございましたらご遠慮なくご発言ください。
今後もどうぞよろしくお願い申し上げます。