いつもお世話になっております。江村です。
マーカの設定で「単語のみ」を有効にしていると、１文字範囲選択した場合にその文字がハイライトされません。これは仕様でしょうか。
[単語のみ] チェック ボックスが設定されている場合は、単語全体が文字列の場合のみ選択テキストを強調します。
https://www.emeditor.org/ja/dlg/customize_markers/auto_marker/index.html
をご覧ください。
表示の設定で 文字間の数値を０⇒１ などに設定した場合、ハイライトがずれていきます。
次のバージョンで修正します。ご報告ありがとうございます。
今後もよろしくお願いいたします。