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[一時ファイルを使う最小サイズ] を大きくしたところ、マーカーが表示されるようになりました。
しかしながら、普通に使っていて [一時ファイルを使う最小サイズ] がマーカー等に影響を与えるとは想像もできません。
[一時ファイルを使う最小サイズ] 設定のところに注意書き等できないでしょうか。

他にはどんなところで 機能が犠牲になっているのですか？