本来は、アンインストール時にこれらのファイルが削除されるはずなのですが、なんらかの原因で、削除されなかったようです。これらのファイルを削除するためには、まず、EmEditor のトレイ アイコンを起動しているショートカットを削除する必要があります。そのためには、
Q. EmEditor のトレイ アイコンを表示しないようにしたいけど、どのようにしたら、トレイ アイコンを表示しないようになりますか?
の手順にしたがって、ショートカットを削除します。
次に、タスク バーに EmEditor のトレイ アイコンがあるはずなので、それをクリックして、「トレイ アイコンを閉じる」を選択します。その後、EMEDTRAY.EXE と EMEDRES.DLL を削除することができます。